Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRN3Q0VDG4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.6 ms