Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms