Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms