Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms