Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms