Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms