Protein–RNA interactions for Protein: Q01415

GALK2, N-acetylgalactosamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALK2Q01415 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GALK2Q01415 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GALK2Q01415 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GALK2Q01415 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GALK2Q01415 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms