Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLTCQ00610 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms