Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms