Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFAMQ00059 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms