Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms