Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIM1P81133 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIM1P81133 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIM1P81133 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SIM1P81133 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIM1P81133 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIM1P81133 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIM1P81133 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIM1P81133 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIM1P81133 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIM1P81133 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIM1P81133 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIM1P81133 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIM1P81133 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SIM1P81133 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIM1P81133 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIM1P81133 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIM1P81133 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIM1P81133 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIM1P81133 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SIM1P81133 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIM1P81133 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIM1P81133 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIM1P81133 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIM1P81133 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIM1P81133 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIM1P81133 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIM1P81133 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIM1P81133 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIM1P81133 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIM1P81133 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIM1P81133 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIM1P81133 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SIM1P81133 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIM1P81133 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIM1P81133 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIM1P81133 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIM1P81133 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIM1P81133 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SIM1P81133 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIM1P81133 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIM1P81133 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIM1P81133 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIM1P81133 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIM1P81133 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIM1P81133 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIM1P81133 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SIM1P81133 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIM1P81133 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIM1P81133 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIM1P81133 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIM1P81133 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SIM1P81133 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIM1P81133 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIM1P81133 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIM1P81133 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIM1P81133 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIM1P81133 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIM1P81133 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIM1P81133 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIM1P81133 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SIM1P81133 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SIM1P81133 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIM1P81133 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIM1P81133 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIM1P81133 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIM1P81133 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIM1P81133 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIM1P81133 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIM1P81133 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIM1P81133 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIM1P81133 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SIM1P81133 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIM1P81133 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms