Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms