Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG2P63267 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms