Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL11P62913 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL11P62913 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL11P62913 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL11P62913 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL11P62913 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL11P62913 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL11P62913 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL11P62913 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL11P62913 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL11P62913 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL11P62913 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL11P62913 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL11P62913 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL11P62913 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL11P62913 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL11P62913 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL11P62913 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL11P62913 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL11P62913 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL11P62913 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL11P62913 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL11P62913 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL11P62913 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL11P62913 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL11P62913 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL11P62913 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL11P62913 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL11P62913 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL11P62913 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL11P62913 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL11P62913 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL11P62913 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL11P62913 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL11P62913 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL11P62913 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL11P62913 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL11P62913 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL11P62913 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL11P62913 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL11P62913 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL11P62913 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL11P62913 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL11P62913 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL11P62913 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL11P62913 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL11P62913 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL11P62913 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL11P62913 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL11P62913 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL11P62913 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL11P62913 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL11P62913 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL11P62913 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL11P62913 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL11P62913 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL11P62913 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL11P62913 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL11P62913 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL11P62913 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL11P62913 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL11P62913 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL11P62913 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL11P62913 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL11P62913 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL11P62913 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL11P62913 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL11P62913 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL11P62913 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL11P62913 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL11P62913 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL11P62913 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms