Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms