Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms