Protein–RNA interactions for Protein: P55318

FOXA3, Hepatocyte nuclear factor 3-gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXA3P55318 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms