Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ELLP55199 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ELLP55199 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ELLP55199 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ELLP55199 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ELLP55199 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ELLP55199 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ELLP55199 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ELLP55199 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ELLP55199 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ELLP55199 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ELLP55199 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ELLP55199 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ELLP55199 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ELLP55199 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ELLP55199 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELLP55199 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELLP55199 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELLP55199 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELLP55199 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELLP55199 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELLP55199 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELLP55199 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELLP55199 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELLP55199 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELLP55199 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELLP55199 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELLP55199 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELLP55199 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELLP55199 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELLP55199 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELLP55199 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELLP55199 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELLP55199 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELLP55199 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELLP55199 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELLP55199 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELLP55199 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELLP55199 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELLP55199 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELLP55199 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELLP55199 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELLP55199 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELLP55199 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELLP55199 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ELLP55199 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELLP55199 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELLP55199 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELLP55199 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELLP55199 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELLP55199 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELLP55199 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ELLP55199 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELLP55199 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELLP55199 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELLP55199 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELLP55199 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELLP55199 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELLP55199 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms