Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms