Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms