Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA3P52797 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms