Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
SMARCA2P51531 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SMARCA2P51531 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms