Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNA2P51530 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNA2P51530 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNA2P51530 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNA2P51530 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNA2P51530 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNA2P51530 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNA2P51530 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNA2P51530 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNA2P51530 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNA2P51530 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNA2P51530 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNA2P51530 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNA2P51530 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNA2P51530 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNA2P51530 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNA2P51530 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNA2P51530 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNA2P51530 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNA2P51530 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNA2P51530 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNA2P51530 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNA2P51530 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNA2P51530 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNA2P51530 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNA2P51530 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNA2P51530 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNA2P51530 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNA2P51530 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNA2P51530 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNA2P51530 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNA2P51530 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNA2P51530 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNA2P51530 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNA2P51530 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNA2P51530 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNA2P51530 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNA2P51530 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNA2P51530 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNA2P51530 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNA2P51530 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNA2P51530 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNA2P51530 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNA2P51530 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNA2P51530 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNA2P51530 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNA2P51530 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNA2P51530 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNA2P51530 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNA2P51530 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNA2P51530 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNA2P51530 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DNA2P51530 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNA2P51530 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNA2P51530 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNA2P51530 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNA2P51530 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNA2P51530 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNA2P51530 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNA2P51530 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNA2P51530 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNA2P51530 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNA2P51530 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNA2P51530 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNA2P51530 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNA2P51530 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNA2P51530 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNA2P51530 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNA2P51530 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNA2P51530 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNA2P51530 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNA2P51530 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNA2P51530 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNA2P51530 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms