Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTPAP49638 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTPAP49638 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTPAP49638 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTPAP49638 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTPAP49638 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTPAP49638 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TTPAP49638 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTPAP49638 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTPAP49638 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTPAP49638 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTPAP49638 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTPAP49638 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTPAP49638 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTPAP49638 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTPAP49638 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TTPAP49638 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TTPAP49638 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTPAP49638 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTPAP49638 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTPAP49638 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTPAP49638 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTPAP49638 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTPAP49638 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTPAP49638 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTPAP49638 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTPAP49638 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTPAP49638 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTPAP49638 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTPAP49638 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTPAP49638 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTPAP49638 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTPAP49638 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTPAP49638 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTPAP49638 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTPAP49638 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTPAP49638 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTPAP49638 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTPAP49638 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTPAP49638 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTPAP49638 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTPAP49638 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTPAP49638 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTPAP49638 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTPAP49638 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTPAP49638 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTPAP49638 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTPAP49638 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTPAP49638 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTPAP49638 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTPAP49638 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TTPAP49638 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTPAP49638 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTPAP49638 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTPAP49638 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTPAP49638 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTPAP49638 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTPAP49638 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTPAP49638 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTPAP49638 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTPAP49638 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTPAP49638 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTPAP49638 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTPAP49638 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTPAP49638 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTPAP49638 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTPAP49638 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTPAP49638 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTPAP49638 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTPAP49638 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTPAP49638 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTPAP49638 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTPAP49638 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTPAP49638 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTPAP49638 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTPAP49638 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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