Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTAP49354 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTAP49354 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FNTAP49354 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTAP49354 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTAP49354 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTAP49354 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTAP49354 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTAP49354 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTAP49354 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTAP49354 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTAP49354 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTAP49354 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTAP49354 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTAP49354 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTAP49354 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTAP49354 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTAP49354 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTAP49354 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNTAP49354 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNTAP49354 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNTAP49354 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNTAP49354 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNTAP49354 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNTAP49354 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNTAP49354 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNTAP49354 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNTAP49354 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNTAP49354 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNTAP49354 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNTAP49354 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNTAP49354 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNTAP49354 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNTAP49354 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNTAP49354 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNTAP49354 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNTAP49354 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNTAP49354 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNTAP49354 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNTAP49354 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNTAP49354 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNTAP49354 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNTAP49354 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNTAP49354 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNTAP49354 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNTAP49354 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNTAP49354 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNTAP49354 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNTAP49354 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNTAP49354 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FNTAP49354 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNTAP49354 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNTAP49354 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNTAP49354 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNTAP49354 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNTAP49354 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNTAP49354 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNTAP49354 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNTAP49354 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNTAP49354 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNTAP49354 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNTAP49354 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNTAP49354 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNTAP49354 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNTAP49354 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNTAP49354 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNTAP49354 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNTAP49354 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNTAP49354 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNTAP49354 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNTAP49354 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FNTAP49354 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNTAP49354 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNTAP49354 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNTAP49354 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms