Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK8P49336 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK8P49336 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK8P49336 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK8P49336 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK8P49336 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK8P49336 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK8P49336 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK8P49336 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK8P49336 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK8P49336 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK8P49336 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK8P49336 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK8P49336 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK8P49336 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK8P49336 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK8P49336 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK8P49336 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK8P49336 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK8P49336 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK8P49336 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK8P49336 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK8P49336 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK8P49336 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK8P49336 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK8P49336 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK8P49336 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK8P49336 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK8P49336 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK8P49336 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK8P49336 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK8P49336 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK8P49336 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK8P49336 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK8P49336 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK8P49336 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK8P49336 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK8P49336 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK8P49336 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK8P49336 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK8P49336 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK8P49336 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK8P49336 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK8P49336 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK8P49336 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK8P49336 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK8P49336 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK8P49336 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK8P49336 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK8P49336 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK8P49336 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK8P49336 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK8P49336 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK8P49336 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK8P49336 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK8P49336 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK8P49336 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK8P49336 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK8P49336 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK8P49336 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK8P49336 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK8P49336 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK8P49336 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK8P49336 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK8P49336 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK8P49336 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK8P49336 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK8P49336 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK8P49336 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK8P49336 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK8P49336 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK8P49336 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK8P49336 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK8P49336 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK8P49336 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK8P49336 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK8P49336 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK8P49336 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK8P49336 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK8P49336 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK8P49336 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK8P49336 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK8P49336 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK8P49336 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK8P49336 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK8P49336 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK8P49336 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK8P49336 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK8P49336 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK8P49336 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK8P49336 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK8P49336 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK8P49336 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK8P49336 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK8P49336 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK8P49336 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK8P49336 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK8P49336 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK8P49336 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK8P49336 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms