Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIP4K2AP48426 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIP4K2AP48426 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIP4K2AP48426 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIP4K2AP48426 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIP4K2AP48426 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIP4K2AP48426 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIP4K2AP48426 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIP4K2AP48426 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIP4K2AP48426 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIP4K2AP48426 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIP4K2AP48426 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIP4K2AP48426 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PIP4K2AP48426 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms