Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SSR1P43307 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSR1P43307 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSR1P43307 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSR1P43307 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SSR1P43307 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSR1P43307 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSR1P43307 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSR1P43307 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSR1P43307 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSR1P43307 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSR1P43307 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSR1P43307 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSR1P43307 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSR1P43307 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSR1P43307 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSR1P43307 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSR1P43307 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSR1P43307 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSR1P43307 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR1P43307 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR1P43307 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR1P43307 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR1P43307 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR1P43307 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR1P43307 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR1P43307 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR1P43307 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR1P43307 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR1P43307 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR1P43307 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR1P43307 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR1P43307 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR1P43307 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR1P43307 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR1P43307 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR1P43307 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR1P43307 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR1P43307 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR1P43307 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR1P43307 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR1P43307 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR1P43307 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR1P43307 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR1P43307 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR1P43307 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR1P43307 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR1P43307 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR1P43307 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR1P43307 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR1P43307 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR1P43307 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR1P43307 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR1P43307 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR1P43307 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR1P43307 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR1P43307 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR1P43307 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR1P43307 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR1P43307 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR1P43307 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR1P43307 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR1P43307 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR1P43307 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR1P43307 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR1P43307 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR1P43307 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR1P43307 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR1P43307 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR1P43307 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR1P43307 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR1P43307 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR1P43307 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR1P43307 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR1P43307 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR1P43307 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR1P43307 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR1P43307 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR1P43307 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR1P43307 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR1P43307 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR1P43307 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR1P43307 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SSR1P43307 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR1P43307 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR1P43307 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR1P43307 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR1P43307 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR1P43307 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR1P43307 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR1P43307 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR1P43307 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR1P43307 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR1P43307 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR1P43307 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR1P43307 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR1P43307 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR1P43307 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR1P43307 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR1P43307 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms