Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms