Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6BP35913 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6BP35913 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6BP35913 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6BP35913 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6BP35913 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6BP35913 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6BP35913 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6BP35913 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6BP35913 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6BP35913 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6BP35913 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6BP35913 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6BP35913 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6BP35913 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6BP35913 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6BP35913 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6BP35913 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6BP35913 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6BP35913 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms