Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.138e-7■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 AL390719.1-202ENST00000394517 397 ntTSL 510.94□□□□□ -0.668e-7■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 ANKMY1-205ENST00000391988 569 ntTSL 522.84■■□□□ 1.257e-8■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 PEX26-204ENST00000474897 2082 ntTSL 520.4■□□□□ 0.866e-17■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.346e-17■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.356e-17■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.712e-10■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.282e-10■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 22e-10■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.792e-10■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.772e-10■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 PCSK6-208ENST00000559417 1035 ntTSL 520.48■□□□□ 0.872e-10■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 ZNF337-203ENST00000481610 572 ntTSL 39.25□□□□□ -0.934e-7■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 ZNF337-201ENST00000252979 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -14e-7■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 PISD-215ENST00000479851 655 ntTSL 322.59■■□□□ 1.213e-7■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 PISD-212ENST00000473770 2378 ntTSL 519.56■□□□□ 0.723e-7■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 PISD-213ENST00000474017 1760 ntTSL 519.03■□□□□ 0.643e-7■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 PISD-205ENST00000429683 609 ntTSL 317.34■□□□□ 0.373e-7■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 PISD-206ENST00000431201 460 ntTSL 417.34■□□□□ 0.373e-7■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 PISD-211ENST00000460723 2534 ntTSL 1 (best)16.85■□□□□ 0.293e-7■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 PISD-217ENST00000491342 692 ntTSL 516.71■□□□□ 0.273e-7■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.013e-7■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 PISD-208ENST00000437808 2264 ntTSL 513.91□□□□□ -0.183e-7■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 PISD-201ENST00000266095 2655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 PISD-207ENST00000435900 1723 ntTSL 511.98□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.146e-11■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.026e-11■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.036e-11■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 ABL2-202ENST00000367623 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.096e-11■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.196e-11■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.221e-9■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 NACC1-203ENST00000586171 534 ntTSL 518.32■□□□□ 0.524e-7■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.354e-7■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 NDUFAF6-218ENST00000523378 949 ntTSL 317.75■□□□□ 0.432e-8■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 NDUFAF6-208ENST00000519136 816 ntTSL 516.05■□□□□ 0.162e-8■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 NDUFAF6-202ENST00000396113 2549 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.092e-8■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 GABBR1-210ENST00000476670 487 ntTSL 423.69■■□□□ 1.388e-12■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.364e-7■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.126e-7■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.044e-7■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 MAD1L1-212ENST00000450235 850 ntTSL 319.21■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.296e-7■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.986e-7■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 BX890604.1-204ENST00000475317 696 ntTSL 217.44■□□□□ 0.386e-7■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 BX890604.1-206ENST00000471090 922 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.026e-7■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 BX890604.1-203ENST00000483854 711 ntTSL 1 (best)7.79□□□□□ -1.166e-7■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 BX890604.1-202ENST00000469903 426 ntTSL 25.16□□□□□ -1.586e-7■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 FBXO31-204ENST00000565593 2717 ntTSL 523.66■■□□□ 1.384e-8■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.334e-8■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.154e-8■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.872e-7■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 ESYT2-202ENST00000275418 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 524.58■■□□□ 1.524e-10■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.364e-10■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.974e-10■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 ESYT2-204ENST00000483958 546 ntTSL 47.97□□□□□ -1.134e-10■■■■■ 30.5
GTF2F1P35269 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.191e-6■■■■■ 30.4
GTF2F1P35269 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 30.4
GTF2F1P35269 USP36-214ENST00000589225 5885 ntTSL 1 (best)16.16■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 30.4
GTF2F1P35269 F7-203ENST00000444337 564 ntTSL 522.1■■□□□ 1.133e-7■■■■■ 30.4
GTF2F1P35269 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.131e-6■■■■■ 30.4
GTF2F1P35269 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 30.4
GTF2F1P35269 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.771e-6■■■■■ 30.4
GTF2F1P35269 WNK2-205ENST00000432730 7792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)18.9■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 30.4
GTF2F1P35269 ACTN4-210ENST00000588618 1729 ntTSL 1 (best)23.66■■□□□ 1.383e-7■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.843e-7■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.593e-7■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 ACTN4-211ENST00000589528 441 ntTSL 217.53■□□□□ 0.43e-7■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 17e-13■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.277e-13■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 BOP1-204ENST00000569403 651 ntTSL 428.77■■■□□ 2.25e-7■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 PLK1-209ENST00000570220 910 ntTSL 318.87■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 PLK1-208ENST00000568568 582 ntTSL 317.14■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 PLK1-204ENST00000564202 584 ntTSL 316.71■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 PLK1-207ENST00000567897 711 ntTSL 316.29■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 PLK1-202ENST00000562272 4135 ntTSL 213.58□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.927e-7■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.617e-7■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.587e-7■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.427e-7■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.297e-7■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.287e-7■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.127e-7■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 VGLL4-206ENST00000418000 792 ntTSL 328.7■■■□□ 2.188e-8■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.668e-8■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.518e-8■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 VGLL4-215ENST00000458499 766 ntTSL 315.49■□□□□ 0.078e-8■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 VGLL4-201ENST00000273038 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.28e-8■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 VGLL4-213ENST00000445411 726 ntTSL 510.46□□□□□ -0.738e-8■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 HECTD4-212ENST00000550724 587 ntTSL 316.1■□□□□ 0.175e-7■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.275e-7■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.225e-7■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 WNK2-206ENST00000448039 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)24.81■■□□□ 1.561e-6■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.666e-14■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.886e-14■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 RAN-205ENST00000477395 762 ntTSL 518.43■□□□□ 0.546e-14■■■■■ 30.3
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 150.4 ms