Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFC1P35251 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RFC1P35251 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFC1P35251 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFC1P35251 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFC1P35251 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFC1P35251 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFC1P35251 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFC1P35251 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFC1P35251 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFC1P35251 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFC1P35251 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFC1P35251 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFC1P35251 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFC1P35251 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFC1P35251 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFC1P35251 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RFC1P35251 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFC1P35251 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RFC1P35251 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFC1P35251 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFC1P35251 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFC1P35251 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFC1P35251 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFC1P35251 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFC1P35251 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFC1P35251 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFC1P35251 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFC1P35251 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFC1P35251 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFC1P35251 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFC1P35251 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFC1P35251 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFC1P35251 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFC1P35251 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFC1P35251 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFC1P35251 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFC1P35251 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFC1P35251 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFC1P35251 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFC1P35251 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFC1P35251 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFC1P35251 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFC1P35251 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFC1P35251 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFC1P35251 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFC1P35251 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFC1P35251 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFC1P35251 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RFC1P35251 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFC1P35251 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFC1P35251 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFC1P35251 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFC1P35251 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFC1P35251 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFC1P35251 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFC1P35251 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFC1P35251 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFC1P35251 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFC1P35251 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFC1P35251 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFC1P35251 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFC1P35251 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFC1P35251 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFC1P35251 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RFC1P35251 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFC1P35251 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RFC1P35251 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFC1P35251 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFC1P35251 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFC1P35251 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFC1P35251 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFC1P35251 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFC1P35251 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFC1P35251 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFC1P35251 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFC1P35251 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFC1P35251 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFC1P35251 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFC1P35251 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFC1P35251 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFC1P35251 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFC1P35251 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFC1P35251 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RFC1P35251 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFC1P35251 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFC1P35251 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFC1P35251 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFC1P35251 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFC1P35251 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFC1P35251 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFC1P35251 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFC1P35251 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFC1P35251 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFC1P35251 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFC1P35251 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFC1P35251 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFC1P35251 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFC1P35251 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFC1P35251 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms