Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC12P31275 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms