Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TSPOP30536 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TSPOP30536 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TSPOP30536 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TSPOP30536 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TSPOP30536 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TSPOP30536 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPOP30536 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPOP30536 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPOP30536 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPOP30536 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPOP30536 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPOP30536 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPOP30536 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPOP30536 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPOP30536 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPOP30536 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPOP30536 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPOP30536 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPOP30536 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPOP30536 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPOP30536 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPOP30536 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPOP30536 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPOP30536 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPOP30536 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPOP30536 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPOP30536 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPOP30536 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPOP30536 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPOP30536 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPOP30536 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPOP30536 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPOP30536 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPOP30536 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPOP30536 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPOP30536 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPOP30536 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPOP30536 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPOP30536 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPOP30536 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPOP30536 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPOP30536 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPOP30536 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPOP30536 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPOP30536 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPOP30536 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPOP30536 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPOP30536 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPOP30536 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms