Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL4A5P29400 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
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