Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID4AP29374 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms