Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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