Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK11BP21127 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms