Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCP20941 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCP20941 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCP20941 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCP20941 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCP20941 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCP20941 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCP20941 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCP20941 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCP20941 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCP20941 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCP20941 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCP20941 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCP20941 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCP20941 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCP20941 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCP20941 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCP20941 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCP20941 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCP20941 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCP20941 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCP20941 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCP20941 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCP20941 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCP20941 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCP20941 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCP20941 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCP20941 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCP20941 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCP20941 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCP20941 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCP20941 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCP20941 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCP20941 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCP20941 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCP20941 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCP20941 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCP20941 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCP20941 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCP20941 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCP20941 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCP20941 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCP20941 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCP20941 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCP20941 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDCP20941 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDCP20941 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCP20941 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCP20941 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCP20941 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCP20941 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCP20941 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCP20941 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCP20941 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCP20941 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCP20941 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCP20941 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCP20941 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCP20941 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCP20941 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCP20941 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCP20941 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCP20941 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCP20941 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCP20941 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCP20941 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCP20941 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCP20941 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCP20941 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCP20941 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCP20941 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCP20941 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCP20941 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCP20941 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCP20941 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCP20941 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCP20941 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCP20941 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCP20941 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCP20941 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCP20941 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCP20941 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCP20941 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCP20941 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCP20941 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCP20941 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCP20941 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCP20941 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms