Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms