Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF3P18847 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF3P18847 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF3P18847 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF3P18847 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF3P18847 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF3P18847 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF3P18847 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF3P18847 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF3P18847 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF3P18847 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF3P18847 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF3P18847 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF3P18847 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF3P18847 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF3P18847 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF3P18847 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF3P18847 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF3P18847 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF3P18847 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF3P18847 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF3P18847 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF3P18847 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF3P18847 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF3P18847 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF3P18847 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF3P18847 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF3P18847 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF3P18847 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF3P18847 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF3P18847 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF3P18847 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF3P18847 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF3P18847 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF3P18847 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF3P18847 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF3P18847 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF3P18847 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATF3P18847 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATF3P18847 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATF3P18847 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATF3P18847 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATF3P18847 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATF3P18847 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATF3P18847 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATF3P18847 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATF3P18847 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATF3P18847 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATF3P18847 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATF3P18847 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ATF3P18847 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATF3P18847 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATF3P18847 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATF3P18847 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATF3P18847 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATF3P18847 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATF3P18847 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATF3P18847 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATF3P18847 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATF3P18847 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATF3P18847 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATF3P18847 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF3P18847 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF3P18847 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF3P18847 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF3P18847 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF3P18847 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF3P18847 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF3P18847 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF3P18847 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF3P18847 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF3P18847 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF3P18847 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF3P18847 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF3P18847 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF3P18847 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF3P18847 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF3P18847 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF3P18847 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF3P18847 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF3P18847 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF3P18847 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF3P18847 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF3P18847 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF3P18847 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF3P18847 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF3P18847 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF3P18847 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF3P18847 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF3P18847 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF3P18847 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF3P18847 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF3P18847 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF3P18847 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF3P18847 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF3P18847 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF3P18847 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF3P18847 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF3P18847 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF3P18847 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms