Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF1P18846 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF1P18846 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF1P18846 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF1P18846 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF1P18846 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF1P18846 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF1P18846 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF1P18846 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF1P18846 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF1P18846 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF1P18846 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF1P18846 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF1P18846 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF1P18846 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF1P18846 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF1P18846 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF1P18846 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF1P18846 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF1P18846 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF1P18846 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF1P18846 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF1P18846 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF1P18846 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF1P18846 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF1P18846 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF1P18846 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF1P18846 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF1P18846 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF1P18846 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF1P18846 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF1P18846 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF1P18846 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF1P18846 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF1P18846 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF1P18846 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF1P18846 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATF1P18846 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATF1P18846 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF1P18846 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF1P18846 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF1P18846 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF1P18846 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF1P18846 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF1P18846 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF1P18846 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF1P18846 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF1P18846 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF1P18846 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF1P18846 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF1P18846 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF1P18846 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF1P18846 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF1P18846 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF1P18846 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF1P18846 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF1P18846 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF1P18846 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF1P18846 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF1P18846 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF1P18846 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF1P18846 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF1P18846 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF1P18846 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF1P18846 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF1P18846 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF1P18846 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF1P18846 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF1P18846 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF1P18846 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF1P18846 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF1P18846 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF1P18846 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF1P18846 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF1P18846 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF1P18846 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF1P18846 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF1P18846 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF1P18846 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF1P18846 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF1P18846 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF1P18846 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF1P18846 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF1P18846 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF1P18846 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF1P18846 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF1P18846 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF1P18846 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF1P18846 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF1P18846 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF1P18846 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF1P18846 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF1P18846 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF1P18846 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms