Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB2P17787 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB2P17787 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms