Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms