Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms