Protein–RNA interactions for Protein: P13861

PRKAR2A, cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR2AP13861 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKAR2AP13861 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAR2AP13861 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms