Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBP3P10745 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBP3P10745 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBP3P10745 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBP3P10745 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBP3P10745 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP3P10745 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP3P10745 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP3P10745 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP3P10745 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP3P10745 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP3P10745 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP3P10745 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP3P10745 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP3P10745 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP3P10745 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP3P10745 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBP3P10745 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBP3P10745 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBP3P10745 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBP3P10745 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBP3P10745 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBP3P10745 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBP3P10745 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBP3P10745 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBP3P10745 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBP3P10745 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBP3P10745 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBP3P10745 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBP3P10745 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBP3P10745 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBP3P10745 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBP3P10745 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBP3P10745 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBP3P10745 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBP3P10745 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RBP3P10745 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBP3P10745 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBP3P10745 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBP3P10745 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBP3P10745 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBP3P10745 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBP3P10745 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBP3P10745 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBP3P10745 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBP3P10745 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBP3P10745 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBP3P10745 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBP3P10745 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBP3P10745 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBP3P10745 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBP3P10745 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBP3P10745 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBP3P10745 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBP3P10745 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBP3P10745 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBP3P10745 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBP3P10745 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBP3P10745 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBP3P10745 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBP3P10745 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBP3P10745 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBP3P10745 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBP3P10745 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBP3P10745 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBP3P10745 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBP3P10745 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RBP3P10745 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBP3P10745 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RBP3P10745 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBP3P10745 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBP3P10745 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBP3P10745 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBP3P10745 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBP3P10745 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBP3P10745 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBP3P10745 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBP3P10745 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBP3P10745 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RBP3P10745 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBP3P10745 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBP3P10745 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBP3P10745 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBP3P10745 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBP3P10745 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBP3P10745 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBP3P10745 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBP3P10745 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBP3P10745 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBP3P10745 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBP3P10745 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBP3P10745 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBP3P10745 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBP3P10745 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RBP3P10745 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBP3P10745 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBP3P10745 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBP3P10745 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBP3P10745 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBP3P10745 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms