Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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