Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms